Добавляем следующие обработчики в init.php и незабываем заменить имя домена на свое

<?php/**
 * ставим авторизованную сессионную куку для родительского
 * домена, чтобы все поддомены ее видели
 */
AddEventHandler(‘main’,’OnAfterUserAuthorize’,function($arUser){
  $m = null;
  if(preg_match(‘/^.+(\.mysite\.com)$/’,$_SERVER[‘SERVER_NAME’],$m))
    setcookie(session_name(),session_id(),0,’/’,$m[1]);
});/**
 * удаляем сессионную куку, если есть вторая от родительского домена
 */
AddEventHandler(‘main’,’OnBeforeProlog’,function(){
  if(!$GLOBALS[‘USER’]::IsAuthorized()
    && ($arHeaders = getallheaders())
    && ($arCookies = explode(‘;’,$arHeaders[‘Cookie’]))
  ){
    $m = null;
    foreach($arCookies as $str)
      if(preg_match(‘/^\s*’.session_name().’=(.*)$/’,$str,$m)
        && $m[1] != session_id()
      ){
        unset($_COOKIE[session_name()]);
        setcookie(session_name(),null,-1,’/’);
        header(‘Refresh:0’);
        die;
      }
 }
});

Исходники на GitHub Gists:

https://gist.github.com/pgooood/3cce10f2fde1edcbe02f95ccbf1fc7c4